无论如何，面对这样的汹汹民意，努尔哈赤也不可能再留下倒霉的镶蓝旗旗主。
虽然大汗对阿敏怀有一定的愧疚之情，但相比绝大部分人的意志，这些愧疚少到可以忽略不计。
努尔哈赤建国称汗时，便置议政五大臣共听国政，断理狱讼。到了天命四年就是今年，这种五大臣议政会议的体制，基本已经流于形式，它存在的唯一意义，仅在于让后金大汗的王令显得更具权威。
历史上，五大臣议政这种近似奴隶部落制的政治体制，在努尔哈赤死后，即被八大贝勒议政代替。后来，八王议政又被皇太极一步步废除，后金逐渐由奴隶制政权渐渐过渡到和大明一样的封建官僚体制。
天命四年三月二十九日，经过额亦都、费英东、何和里、扈尔汉、安费扬古五大臣讨论后，最终做出决定：
废除阿敏镶蓝旗旗主，罚没阿敏全部财产、妻妾，将其降为普通台吉，暂领三个牛录，允许其戴罪立功。
镶蓝旗旗主之位，由济尔哈朗担任。由于这次镶蓝旗伤亡惨重，五大臣决意不做进一步处罚，不再罚没镶蓝旗牛录与其余七旗。
不仅如此，努尔哈赤还下令将正红旗、正白旗、镶蓝旗在开原周边掳掠的两万多人口（尽管镶蓝旗惨败，其余三旗仍有一定收获），分出八千口来，补充给镶蓝旗，三月底，济尔哈朗又从苏不地部落掳掠一千多蒙古丁口，这样以来，镶蓝旗人口勉强恢复到两万左右，接近战前的一半，总算勉强保住它八旗老末的地位。
阿敏在浑江、开原的连续两次失败，导致镶蓝旗士气跌到了谷底。
在这种情况下，为了扭转不利形势，也为排除异己，更为接下来对海西女真的作战行动，刚刚登上旗主位置的济尔哈朗，便将镶蓝旗中层将领全部清洗一遍。
十几个牛录额真被撤换下来，原先和阿敏关系最近的一个甲剌额真，被济尔哈朗以贪污罪处死。
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